四个情同手足的乌龟少年一直生活在隐秘的(de )下水道中，在师父（成龙 配音）的训(xùn )练下，他们成(chéng )为了功夫高超的“忍者神龟”，渴望被人类接纳的四小只，在人类朋友艾普的帮助下，开始追踪一个神秘的犯罪集团，但随着一(yī )支强大变种生(shēng )物军队的降临，同样属于变种生物的忍者神龟(guī )们知道(dào )，这下大麻烦来了……